苏瑾和林悦剿灭水匪，立下赫赫战功，可二人并未有丝毫懈怠，因为他们深知，水匪之乱虽已平息，但后续之事若处理不当，仍会遗患无穷。
“阿瑾，如今水匪已除，可这江上商贸虽有复苏之象，但仍有许多事要做啊。”林悦站在江边，望着重新热闹起来的商船，眉头却依旧微蹙。
苏瑾点头道：“悦儿所言极是。首要之事，便是安置那些受水匪之害的百姓，尤其是那些被水匪劫掠后一无所有的商人。”
二人来到知府衙门，向知府大人禀明想法。知府捋着胡须，满脸忧虑：“二位所言极是，只是府库空虚，赔偿之事，恐难周全。”
苏瑾道：“大人，可令商贾们自行上报损失，官府核实后，按比例从缴获的水匪财物中补偿，不足之数，可让城中富户捐助。富户们为求长久安宁，想必不会拒绝。”
知府点头称是，遂下令照办。苏瑾和林悦又来到城中商会，向众商人说明计划。一位年长的商会首领起身拱手道：“苏大人、林大人此计甚好，我等自当配合。只是，水匪虽除，但江上治安仍需加强，否则日后恐再生事端。”
林悦道：“我与苏大人已有打算。我们欲从此次剿匪的官兵中挑选精悍者，组建一支江上巡防队，常驻江上，护卫商船。”
商人们纷纷称善。苏瑾接着道：“这巡防队的费用，一部分可从商会收取，作为保护费，此非昔日水匪之强取豪夺，而是为保大家平安；另一部分由官府补贴。不知各位意下如何？”
众商人商议后，皆表示赞同。
在处理赔偿和巡防之事的同时，苏瑾和林悦并未忘记那些被水匪裹挟的普通渔民。他们再次来到江边渔村，召集村民。
苏瑾站在高台上，大声道：“各位乡亲，水匪已除，过往之事，官府不再追究。但今后，切不可再与匪类勾结，否则定不轻饶。”
一位年轻渔民上前道：“大人，我们也是被逼无奈啊。水匪抓了我们的亲人，若不听从，亲人便有性命之忧。”
林悦道：“我们明白你们的苦衷。如今水匪已灭，你们可安心生活。若有困难，可向官府求助。”
渔村之事处理妥当后，苏瑾和林悦又开始关注那些投降的水匪。在狱中，苏瑾看着那些水匪，神色严肃：“你们犯下的罪孽，本当严惩。但如今朝廷有好生之德，若你们能改过自新，可免一死。”
水匪们纷纷磕头求饶。林悦道：“你们需将所知的其他匪患线索告知官府，并且日后要为百姓做些善事，以赎前罪。”
其中一个水匪道：“大人，我们知道还有一些散匪，他们在江上其他偏僻之处还有巢穴，时常劫掠过往小船。”
苏瑾和林悦立刻派人根据线索去剿灭那些散匪，同时，让投降的水匪参与一些苦力劳作，如修缮江边堤坝、为渔村修路等，以劳赎罪。