为了促成朱慈炯尽快登基，巩永固特意在晚上拜访了当时颇具声望的文人钱谦益。
巩永固踏入钱谦益的府邸，刚一落座就问道：“本督听说钱夫子拥戴潞王，可有此事？”
钱谦益一听此言，心中大骇，连忙跪拜在地，脸色苍白。
他深知，在这个敏感的时刻，任何与永王争夺皇位的行为都将被视为大逆不道，而他煽动众官迎立潞王的举动几乎人所众知。
钱谦益心中七上八下，连连哀求巩永固，希望能够得到宽恕。
巩永固扶起钱谦益，语气和缓地说道：“钱夫子，明日你去龙江关舟中，力请永王继位。这样，你也就有了拥立之功，这件事自然大事化小，小事化了。”
巩永固的话让钱谦益看到了一线生机。
他明白，这是巩永固给他的一个机会，一个可以挽回自己政治生涯的机会。
钱谦益感激涕零，连连称是。
他知道，自己必须抓住这个机会，为新君登基尽一份力。只有这样，他才能在这场政治风波中保全自己，甚至获得更高的地位。
翌日百官们身着朝服，肃立于龙江关舟旁，他们眼神中充满期待，准备迎见即将改变大明命运的朱慈炤。
随着江面上舟船缓缓靠岸，朱慈炤的身影在众人焦急的目光中逐渐清晰。他身着一袭华贵的龙袍，神态庄重而威严，举手投足间流露出皇家独有的风范，却又不失对臣民的亲和力。
百官们见状，纷纷走上前来，躬身行礼，齐声道：“参见永王殿下，恳请殿下监国，以安天下之心。”
他们的声音铿锵有力，透露出对朱慈炤的无比信任和期待。
在这庄重而紧张的时刻，钱谦益站了出来。
他立即跪倒在地，双手高举过头，大声喊道：“国不可一日无君，如今人心慌乱，一切从权，请永王殿下即日登基为帝，以安民心，定国运！”
钱谦益的话音刚落，护卫永王的艾双双部步兵近万人、李明山部九千人齐声高呼：“请永王登基为帝！请永王登基为帝！”
声音如同雷鸣般震撼人心，回荡在江面上，久久不散。
朱慈炤站在舟头，目光如炬，扫过在场的每一位官员。他的目光最终定格在巩永固身上，巩永固微微点头，示意朱慈炤应当顺应天意，登基称帝。
朱慈炤深吸了一口气，沉声道：“众卿平身。太子哥哥下落不明，孤只能负起中兴大明的重任！称帝与否，孤不在乎！但孤不能冷了众军的心。孤宣布，从即日起，孤登基称帝，号大明朝皇帝，与众卿共谋国是，重振大明！”
曹化淳一愣，他原以为按照常理，朱慈炤应该三次推却，再由群臣再三恳请，最后才能登基称帝。然而，朱慈炤却直接宣布登基，这让他感到有些意外。
朝臣们也纷纷露出惊讶之色，但随即他们便明白过来，这是朱慈炤为了稳定军心、民心而做出的果断决定。
他们纷纷跪倒在地，高呼万岁，声音响彻云霄，表达了对新帝的忠诚和拥戴。
四月十五日，清晨的阳光洒满了南京城，朱慈炤身着匆匆改制的龙袍，骑马自三山门出，沿着城墙向东缓缓骑行，目光所及之处，皆是繁华的街市和忙碌的百姓。
朱慈炤在韩赞周、曹化淳的引领下，首先来到了孝陵、懿文太子陵祭奠。
拜谒完两位先人的陵墓后，朱慈炤骑马经朝阳门入东华门，来到了奉先殿。
这里是供奉历代皇帝牌位的地方，也是他向先祖们表示敬意和祈求庇佑的场所。
他恭敬地献上香火，祈祷大明江山永固，国运昌盛。
从奉先殿出来，朱慈炤直奔皇宫，正式继位。进熹宗张皇后为懿安皇太后，母田贵妃为惠安太后。
由于朱慈炤年纪太小，巩永固建议两宫太后垂帘听政。
接下去的五天里，巩永固、曹化淳、卢象升、韩赞周、钱谦益及两宫太后等人反复商讨人事安排，最终决定巩永固、卢象升、李邦华、方岳贡、钱谦益担任内阁大学士，李邦华出任内阁首辅，卢象升为次辅。
同时，任命巩永固以内阁大学士、两江总督，总督北方抗清一切事宜。
史可法、高宏图图谋立桂王为帝，撤除兵部尚书、户部尚书衔，分别改任绍兴知府、宁波知府。
兵部尚书由巩永固兼任，原兵部主事金铉出任兵部侍郎。
刑部尚书由崇祯朝孟兆祥担任，户部尚书由左庶子李明睿担任，礼部尚书由钱谦益兼任，工部尚书由崇祯朝兵部右侍郎王家彦担任，吏部尚书由卢象升兼任。
刘文柄任京营总督，原两江总督府长史杨廷麟出任南京京营同知，曹化淳担任司礼监掌印太监兼东厂提督。
应天巡抚由苏州知府陈洪谧出任，卢象观出任苏州知府。
青浦知县万安被巩永固破格提升为应天府尹，一直负责《江南晨报》的徐孚远兼任户部员外郎。
巩永固本想提拔原大理寺卿凌义渠出任内阁大学士，不料，凌义渠认为自己罪孽深重，未能尽忠，拒绝出任朝廷官职。对于巩永固提议他担任大明书局经理的提议，他慨然应允。
原内阁大学士范景文认为自己反对崇祯南迁，导致崇祯自缢。他坚决不愿出任大学士，巩永固无奈，推荐他担任淮安知府。
两淮盐运使周亮工出任扬州知府，陈子龙出任松江府知府，巩永固的护卫、孙传庭之子孙世瑞出任华亭县知县。
艾双双出任南京十三门提督，合并羽林左卫、右卫为羽林卫，由协统姜宏出任指挥使，合并金吾前卫、后卫为金吾卫，协统方辉担任指挥使，锦衣卫指挥使由巩永固亲卫巩耀担任。
巩永固尚未出发之时，得到杨陆凯传来的消息，许德士和四名亲兵已经随山西范家的商队到达了盛京。
据报，顺治帝赐睿亲王多尔衮“奉命大将军”印后，多尔衮下令，十岁以上七十岁以下的男子一律从军，倾八旗之力，大举南下进军山海关。
得到巩德传来的消息，大顺军在京城拷掠官员勋贵得到白银七千万两。
同时，人心尽失，投降的官员后悔不迭。