这天小智一行人来到了关东的旅行圣地蓝普鲁奇市，来到蓝普鲁奇市宝可梦中心时还遇到了大木博士和小茂。
“小智好久不见啊，拿到几个徽章了？？我已经拿到四枚徽章了哦。”小茂见到小智的到来后拿出自己的徽章之后上前炫耀道。
“哦，我是三枚。”小智看了一眼小茂的四枚徽章不过都是普通徽章并不是和道馆主进行全力对战所获得的真道馆徽章。
“什么才三枚。。。”小茂看到小智的三枚徽章后刚准备嘲笑一番就被大木博士给打断了。
“小茂你可别小瞧小智的这三枚徽章，这可是和道馆主的真实实力战斗并战胜所给的真道馆徽章不是你这四枚道馆徽章可以媲美的。”大木博士看到小智的三枚道馆徽章之后上前对着小茂说道。
“什么！！真道馆徽章！！”小茂听到自己爷爷的话之后惊讶道。
“没错我挑战这些道馆的时候都是让馆主拿出全部实力来打的。”小智此时也说道。
“小智你带我们去你的空间里面看看你收服的宝可梦们吧，你能获取到三枚真道馆徽章有几只宝可梦进化到最终形态了吧，
你的所有的宝可梦都存放在空间内你也不怎么联络我我都不知道你的宝可梦的情况。”大木博士并不想知道小智道馆的相关事宜而对小智的宝可梦们有兴趣说道。
“那就跟我来吧。”小智听到大木博士的话之后借助幻月的力量打开了空间的大门，来到空间内之后用幻月的力量发出特殊的声音将众宝可梦除星辰之龙和小蓓以外的宝可梦召集了过来。
“神奥地区的准神宝可梦尖牙陆鲨，闪光丰缘地区的准神金属怪，还有关东的御三家，这只火恐龙的身上的这些纹身又是什么？？
还有帕迪亚地区都极为稀有的宝可梦苍炎刃鬼！！”大木博士看到小智的宝可梦们后双眼放光的看着冲上去观察着。
众宝可梦们见到大木博士的动作本来要进行攻击了的被小智挥了挥手阻止了。
“这是大木博士是我的熟人，他最近会待在空间内一段时间，要你们做什么你们按照做就可以了。”小智看着一直观察宝可梦们的大木博士无奈的对着众宝可梦说道。
小智和小茂，小刚，小月则是离开了空间只留下众宝可梦和大木博士在里面。
小智一行人先是在宝可梦中心休息了一天，第二天告别了大木博士和小茂，继续在蓝普鲁奇市内逛了起来。
“有一只巨型毒刺水母带领着大量的玛瑙水母攻击着城市大家快点去避难。”就在小智一行人正在逛街的时候一名男子开着车路过这里说道，随后驾车朝着城市外离去。
“巨大毒刺水母？？那附近的极巨能量不够宝可梦进行极巨化啊，怎么会出现如此巨大的毒刺水母，我们到那边去看吧。”小智借助幻月的力量看到男子所说的巨大毒刺水母和探查了一下附近的极巨能量说道。
“嗯x2。”小月和小刚听到小智的话之后也附和道。
小智随后放出了大比鸟和金属怪快速来到了巨大毒刺水母的附近。
“可恶的人类，既然你们要破坏我们赖以生存的环境的话那么你们也别想好过。”巨型毒刺水母的一只触手抓住一只喵喵，操控着喵喵说道。
巨型毒刺水母一边说着还一边发动攻击破坏着蓝普鲁奇市的市区。
“住手吧毒刺水母，你已经将城市破坏成这样泄愤了吧，我等一下会和他们商量不在你们生存地点再建房子而打扰你们的，所以住手吧。”小月听到毒刺水母的话后看到远处珊瑚礁群上的房子说道。
但是在气头上的毒刺水母那听得进去，直接一发水炮朝着小月打来，小智立马冲到了小月的身前，小智脖子上的金轮释放出一块蓝色的石板将水炮全部吸收了。
“小月你先去到一边吧，毒刺水母正在气头上不可能听我们的话的，只能先用武力镇压它了。”小智将小月拉倒一边说道。
“好，小智你小心点。”小月看着还在破坏城市的巨型毒刺水母对着小智说道。
“放心吧，我有把握，实在不行还有星辰之龙呢，上吧沙奈朵，沙奈朵使用精神强念，皮卡丘使用超级巨万雷轰顶。”小智将沙奈朵放了并且将肩膀上的皮卡丘的皮卡丘超极巨化了之后说道。
小智借助幻月的力量将附近的一大半的极巨能量才做到了将皮卡丘进行超极巨化，这附近极巨能量少的可怜，毒刺水母身上也没有极巨能量真不知道怎么变这么大的。
超极巨皮卡丘身上朝着天空中的红云释放了一道电流，随后没多久一道粗大的电系能量从红云之中朝着毒刺水母劈了下去。
沙奈朵则是双眼泛蓝朝着毒刺水母打出一道强力的精神力，不过因为毒刺水母的身形过于巨大的缘故造成的伤害非常低。
给毒刺水母造成了想当大的伤害，被雷电劈和沙奈朵的精神力打中的毒刺水母更加生气了将触手上的喵喵扔飞后朝着皮卡丘打出一股极其强劲的水炮，一条粗大的触手打向了沙奈朵。
皮卡丘硬生生吃了这一击水炮，沙奈朵则是利用瞬间移动躲开了这一条触手。
“好强的威力啊！！！仅仅是一鞭就毁了小半个城区，皮卡丘不要给它喘息的机会全力使用超极巨万雷轰顶，沙奈朵全力使用精神强念。”小智看到被毒刺水母的触手所毁灭掉的城市惊讶道。
皮卡丘汇聚全身的电力朝着天空中打出一道电流，随后以一条比之前要粗上两倍的电流朝着毒刺水母劈了下去。
沙奈朵则是汇聚了全身的超能力系能量朝着毒刺水母打了过去，迅速的将毒刺水母全身覆盖，并且将毒刺水母控制住不让其反击。
皮卡丘的超极巨万雷轰顶就这样直接劈在了毒刺水母的身上，毒刺水母被这一击直接打的失去了战斗能力。
小智见状拿出一颗之前从大木博士那里敲诈来的捕网球朝着巨型毒刺水母扔了过去，捕网球将毒刺水母收纳进精灵球摇晃了几分钟才停了下来，在噔的一声下将其收服了。
周围的玛瑙水母们看到自己的老大被打败并且收服了之后全部都退走了。
小智等人见状回到了蓝普鲁奇市内，得知了一切的始因后将这件事告诉给了渡，之前月见山后小智和渡互换了联系方式，今天正好派上了用处，最后始作俑者被联盟给抓了起来听说她下半辈子都要在牢狱里面度过了。